1944年，史语所、中央博物院筹备处、中国地理研究所、北京大学文科研究所合组西北科学考察团，考古方面由向达、夏鼐、阎文儒负责。他们调查了兰州十里店、西果园一带的史前遗址，又自酒泉往金塔北海子探汉代烽燧遗址、瓜州故城；5月，在敦煌附近发掘魏晋和唐代墓葬；11月，考察汉玉门关、阳关和长城、烽燧遗址，发现一批汉代木简。1945年春，夏鼐在甘肃宁定县阳洼湾齐家墓葬发掘中，从墓葬的墟土中找到了仰韶文化的彩陶片，从地层证据证明齐家文化晚于仰韶文化，他写了《齐家墓葬的新发现及其年代的改正》一文纠正了安特生关于齐家期早于仰韶期的年代错误。
除上述规模较大的考古活动外，在四川还有不少零星的考古活动。1937年，中央大学金毓黻、常任侠等在重庆附近调查崖墓，后又调查清理沙坪坝汉墓。1940年，卫聚贤、郭沫若、常任侠调查重庆江北培善桥汉墓遗物。1941年，凌纯声、马长寿等在理番发掘汉墓。1942年，史语所和中央博物院筹备处合作进行川康古迹考察发掘，在陈家偏、牧马山老江口、李家沟等处发现了一批史前时期和汉代遗存等。
原在史语所、抗战初期奔赴延安的尹达于1942年在延安大砭沟发现了龙山文化遗址，还出版了《中国原始社会》一书。1946年，他又在华北解放区邯郸附近清理一座汉墓，首次发现了散乱的玉衣片。
